Kalau di lihat dari log .id pun timeout.
Default whois untuk .id whmcs adalah whois.pandi.or.id yang lokasinya di indonesia.
Jadi seharusnya tidak terkait masalah bandwidth international nya.
Coba di cek kembali apakah port TCP 43 ke luar servernya terbuka atau tidak.
Jika masnya tidak mengelola servernya bisa minta ke pengelola servernya mengecek port tersebut.